WellWishes in 2014 gestart als project binnen de stichting Educaid, een aan de hogeschool Windesheim in Zwolle gelieerde organisatie voor ontwikkelingssamenwerking. Vanaf 27 januari 2016 opereert WellWishes als zelfstandige stichting.
WellWishes is aangesloten bij Partin, Goede Doel Shop en GeefGratis en heeft de ANBI-status.